アウトドアが唯一の趣味であるヤマトは、慣れ親しんだはずの登山中に突然強い光に包まれ、異世界に転移してしまう。一宿一飯のお礼に、貧村を救おう！と奮闘し――3年目の春、ウルド村は復興し、活力を取り戻しつつあった。笑顔の村民たちの中、「迫りくる危機」に対処しようと旅の準備を進めるヤマト。帝都を恐怖に陥れた霊獣管理者（レイジュウマスター）の手掛かりをつかむため、ヤマトは一人で聖都へと向かおうとするが、それに感づいたリーシャ、シルドリアらが放っておくはずもなく……
手掛かりは、「聖女」。彼女と面会しなければならないが、聖女に会うのは一国の主でも難しいとされていた。ヤマトが頼ったのは、まさかの人物で――？
ついにクライマックス！